Новое исследование показало, что CRISPR/Cas9 приводит к неожиданным геномным изменениям

Широко используемый метод генных ножниц (CRISPR/Cas) может модифицировать генетическое содержимое клеток для изучения молекулярных ролей генов и приобрел большое клиническое значение в генной терапии для лечения генетических заболеваний. Новое исследование, проведенное исследовательской группой Клаудии Каттер на кафедре микробиологии, клеточной и опухолевой биологии Каролинского института, показало, что генные ножницы приводят к неожиданным геномным изменениям.

«Мы обнаружили, что CRISPR/Cas9 вызывает непредсказуемые целевые геномные эффекты, влияющие на рост раковых клеток. раковые клетки росли быстрее. Учитывая, что разработка генома CRISPR/Cas стала распространенным инструментом в исследованиях и клинических применениях, мы считаем, что наше новое понимание, а также наш инновационный и надежный подход будут полезны при оценке геномных изменений», — говорит соответствующий автор Клаудия Каттер, директор. научный сотрудник отдела микробиологии, клеточной и опухолевой биологии Каролинского института.

Исследовательская группа разработала новый подход для расшифровки геномных изменений с высоким разрешением и выявления различных геномных эффектов в целевом локусе.

«Чтобы объяснить удивительный фенотип клеток, мы объединили новейшие технологические подходы. Во-первых, мы специально обогатили нашу целевую генетическая последовательность в микрокаплях (Xdrop). Во-вторых, мы считываем генетическую последовательность с помощью технологии секвенирования с нанопорами (ONT-LRS). Наконец, мы разработали сложный вычислительный конвейер, который расшифровал точные изменения в геномной последовательности», — говорит первый автор Кейи Генг, аспирант в исследовательской группе Клаудии Каттер.

Статья опубликована в Геномные исследования. В настоящее время исследовательская группа изучает другие эффекты CRISPR/Cas в клетках человека, уделяя особое внимание раковым клеткам, избежавшим лечения рака.

«Это помогает нам понять, как наш генетический материал восстанавливается в случае повреждения. Хотя CRISPR/Cas очень эффективен, нам необходимо найти более эффективные способы контроля активности CRISPR/Cas в клетках человека. усилия в моей группе», — говорит Клаудия Каттер.